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“中国人类蛋白质组计划”(CNHPP)6月10日在京全面启动实施，主要目标是以我国重大疾病的防治需求为牵引，发展蛋白质组研究相关设备及关键技术，绘制人类蛋白质组生理和病理精细图谱、构建人类蛋白质组“百科全书”，全景式揭示生命奥秘，为提高重大疾病防治水平提供有效手段，为我国生物医药产业发展提供原动力。
该计划分为三个项目具体实施：“中国人类蛋白质组草图” A类S973项目，“人类蛋白质组大数据库和知识挖掘”国际合作项目和“蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化”863主题项目。复旦大学有关课题组作为核心团队之一深度参与CNHPP计划。化学系和生物医学研究院杨芃原教授担任专项管理委员会委员, 并作为首席科学家领衔“蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化”863主题项目。生物医学研究院申华莉副研究员(课题组长)负责“蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化”项目中的电喷雾-质谱仪器国产化课题, 化学系杨芃原、徐国宾博士参加激光解析基体辅助-质谱仪器国产化课题。中山医院钱菊英教授(课题组长)和生物医学研究院张莉娟博士负责“中国人类蛋白质组草图”项目中的循环系统蛋白质组课题(包括心脏和血细胞)，参加人员还有来自生命科学学院和肿瘤医院的课题组。中山医院刘银坤教授参加“中国人类蛋白质组草图”项目中的消化腺系统蛋白质组课题(肝脏和胰脏等)，肿瘤医院蔡三军教授和生物医学研究院陆豪杰教授参加“中国人类蛋白质组草图”项目中的消化道系统蛋白质组课题(胃、肠等)。化学系张祥民(课题组长)、陆豪杰(课题组长)、邓春辉(课题组长)、杨芃原等教授和基础医学院顾建新教授(课题组长)还为主参加了“中国人类蛋白质组计划”中建立新技术新方法的S973/863项目的有关课题。化学系杨芃原教授负责染色体蛋白质组计划中8号染色体蛋白质组任务，生物医学研究院钟凡副研究员(课题组长)负责染色体蛋白质组计划中缺失蛋白质的发现和验证课题。生物医学研究院吴飞珍副研究员和钟凡副研究员还参与“人类蛋白质组大数据库和知识挖掘”的有关任务。
人类蛋白质组计划(HPP)是继基因组计划之后人类全面探索自我奥秘征程中又一伟大科技工程，是新世纪第一个国际大型科技合作计划。中国科学家率先倡导并领衔了人类第一个器官(肝脏)国际蛋白质组计划(HLPP)，开中国引领国际大型科技合作计划之先河，所形成的理论框架、整体策略和技术标准被国际同行认可和应用，为人类蛋白质组计划的全面展开发挥了示范和指导作用。近4年，中国在这一领域国际核心刊物发文章1000多篇，跃居世界第二。在乙酰化新的代谢通路调控机制、炎症诱发肿瘤、骨形成调节、疾病易感性等方面取得系列原创成果。
CNHPP产生的大数据将全景式地揭示人体蛋白质组成及其调控规律，解读人类基因组这部“天书”。构建的人类蛋白质组生理和病理图谱，将准确呈现各种病理状态下蛋白质组的变化，揭示疾病的发病机制和病理过程，发现系列新型诊断标志物、治疗靶点和创新药物，为全面提高疾病防诊治水平提供新策略新手段。
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